Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS4O43181 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS4O43181 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS4O43181 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms