Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01565O15544 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01565O15544 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01565O15544 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms