Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FABP7O15540 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FABP7O15540 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FABP7O15540 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FABP7O15540 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FABP7O15540 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FABP7O15540 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FABP7O15540 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FABP7O15540 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FABP7O15540 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FABP7O15540 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FABP7O15540 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FABP7O15540 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FABP7O15540 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FABP7O15540 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FABP7O15540 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FABP7O15540 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FABP7O15540 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FABP7O15540 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FABP7O15540 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms