Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBX3O15119 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBX3O15119 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBX3O15119 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBX3O15119 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBX3O15119 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBX3O15119 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBX3O15119 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TBX3O15119 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TBX3O15119 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TBX3O15119 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBX3O15119 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBX3O15119 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBX3O15119 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBX3O15119 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBX3O15119 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBX3O15119 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TBX3O15119 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBX3O15119 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBX3O15119 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBX3O15119 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBX3O15119 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX3O15119 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX3O15119 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX3O15119 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX3O15119 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX3O15119 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX3O15119 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX3O15119 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms