Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SYNMO15061 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SYNMO15061 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYNMO15061 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SYNMO15061 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SYNMO15061 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SYNMO15061 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYNMO15061 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNMO15061 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNMO15061 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNMO15061 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNMO15061 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNMO15061 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYNMO15061 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SYNMO15061 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SYNMO15061 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SYNMO15061 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SYNMO15061 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SYNMO15061 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SYNMO15061 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SYNMO15061 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYNMO15061 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYNMO15061 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYNMO15061 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNMO15061 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNMO15061 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNMO15061 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNMO15061 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNMO15061 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNMO15061 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNMO15061 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNMO15061 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNMO15061 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNMO15061 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNMO15061 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNMO15061 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNMO15061 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNMO15061 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNMO15061 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNMO15061 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNMO15061 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNMO15061 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNMO15061 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNMO15061 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNMO15061 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNMO15061 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNMO15061 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNMO15061 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNMO15061 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNMO15061 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNMO15061 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNMO15061 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYNMO15061 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SYNMO15061 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYNMO15061 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYNMO15061 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNMO15061 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNMO15061 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNMO15061 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNMO15061 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYNMO15061 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms