Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A1O00337 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC28A1O00337 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A1O00337 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms