Protein–RNA interactions for Protein: J3QL48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QL48 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QL48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QL48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QL48 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QL48 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QL48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QL48 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QL48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QL48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QL48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QL48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QL48 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QL48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QL48 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QL48 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QL48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3QL48 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QL48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3QL48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms