Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L12C9JPN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L12C9JPN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L12C9JPN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms