Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DIRC3C9JPN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DIRC3C9JPN6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DIRC3C9JPN6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DIRC3C9JPN6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms