Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PATL2C9JE40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PATL2C9JE40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PATL2C9JE40 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PATL2C9JE40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PATL2C9JE40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PATL2C9JE40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PATL2C9JE40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms