Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms