Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM114B3SHH9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM114B3SHH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM114B3SHH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms