Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM1B2RUZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM1B2RUZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms