Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE1LA8MT33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms