Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC154A6NI56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms