Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTAGE9A4FU28 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms