Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBA6A0AVT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBA6A0AVT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms