Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms