Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4AQ9UMR7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms