Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED23Q9ULK4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms