Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBE1Q9UJT0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms