Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms