Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC4Q9NTJ3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC4Q9NTJ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms