Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms