Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms