Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms