Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRDM12Q9H4Q4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms