Protein–RNA interactions for Protein: Q9H347

UBQLN3, Ubiquilin-3, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3Q9H347 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN3Q9H347 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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