Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

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Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ZNF407Q9C0G0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ZNF407Q9C0G0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ZNF407Q9C0G0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF407Q9C0G0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZNF407Q9C0G0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF407Q9C0G0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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