Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms