Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC11Q9BVV2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms