Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MESP1Q9BRJ9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms