Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FYCO1Q9BQS8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms