Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREX2Q9BQ50 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms