Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms