Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms