Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPAN18Q96SJ8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms