Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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