Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JSRP1Q96MG2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.6 ms