Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SENP8Q96LD8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SENP8Q96LD8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms