Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF34Q969K3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms