Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms