Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPBP1Q92547 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms