Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHIPQ8WWQ0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms