Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TMIEQ8NEW7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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TMIEQ8NEW7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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TMIEQ8NEW7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIEQ8NEW7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TMIEQ8NEW7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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TMIEQ8NEW7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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