Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTC29Q8NA56 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms