Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms