Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms