Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHA9Q7RTU4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms