Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF7Q6Q0C0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms